マリンフォード頂上決戦から２年。再びシャボンディ諸島に集結した“麦わらの一味”は、最後の海・新世界に入るため、通過点となる深海の“魚人島”へ向かう。船を改造し、魚人島・リュウグウ王国に辿り着いた一味だったが、そこには人間と魚人の根深い確執が広がっていた…。人間への復讐のため、王国へのクーデターを起こした“新魚人海賊団”を止めるべく、２年の時を経て成長した一味の戦いが始まる！
