チャンドラー艦長を始め、スラッタリー副長や他の乗組員が、ウイルス学者のレイチェル・スコット博士が発見した治療薬の普及に尽力する。だが、祖国のアメリカに到着した彼らは、エイミー・グランダーソンがトップを務める新世界秩序と敵対する。そしてさらに、世界征服を企む危険な敵が登場する。
